1. 基本信息

徐坤，男，遗传学博士，副教授，博导；久游手机游戏平台官网动物科技学院羊遗传改良与生物育种创新团队、动物生化与分子生物学教研室成员。主要从事动物基因编辑与分子设计育种、微生物基因编辑与合成生物学等方面的教学和科研工作。是最早从事基因编辑技术开发的研究者之一，曾首次报道了源于嗜热链球菌的CRISPR/St3Cas9系统，并相继开发了一系列的基因编辑工具活性报告技术、供体适配基因编辑系统等哺乳动物和酵母基因编辑配套技术。目前致力于新型的OMEGA/Fanzor和TIGR/Tas等“迷你”基因编辑工具的开发及应用研究。累计在《Nature Chemical Biology》、《Trends in Biotechnology》、《Advanced Science》、《Cellular and Molecular Life Sciences》和《生物工程学报》、《遗传》等国内外期刊发表科研论著75篇。发表论文累计被引1105次，H指数17、i10指数25 (谷歌学术，截至2025.05)。个人主页：https://lab.gewu.pro/groups/index/T8B5U1

2. 招生和研究方向

招生专业和方向：动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、畜牧，动物生物技术方向。

研究方向：动物基因编辑与分子设计育种、微生物基因编辑与合成生物学；涉及动物基因编辑技术、动物（羊）分子设计育种、微生物（酵母）基因编辑技术、微生物合成生物学等课题。

3. 教学课程和奖励

主讲：本科生《分子生物学》、《基因编辑技术》、《细胞分子生物学实验》和研究生《动物基因编辑原理和技术》、《基因编辑原理与技术-海南》等课程。

曾经主讲：本科《新生研讨课》、《动物生物化学实验》和研究生《动物基因工程技术》、《动物繁殖理论与生物技术》等课程。

辅讲：本科生《科技英语写作》、《动物分子设计育种》和研究生《动物基因工程技术》、《动物繁殖理论与生物技术》、《动物遗传育种进展》、《现代动物育种学》等课程。

担任巴基斯坦农业“*****************计划”在华培训项目和哈萨克斯坦沙卡里姆大学培训班基因编辑培训课程主讲。

曾获陕西首届高校课堂教学创新大赛三等奖，久游手机游戏平台官网青年教师讲课比赛三等奖，久游手机游戏平台官网教学成果二等奖。《羊分子设计育种与实践》项目入选全国农业教指委“优质案例课堂”。负责久游手机游戏平台官网基因编辑科教平台(Northwest A&F University Gene Editing Scientific Teaching, NWAFU-GEST)，平台主页：https://lab.gewu.pro/groups/index/U1Y0L9

4. 科研项目和成果

累计发表研究论著75篇，其中第一/通讯作者论文42篇（SCI 28篇、中文核心14篇）。申请发明专利18项，其中已授权10项。近五年来，先后承担国家农业生物育种重大专项、国家自然科学基金、陕西省重点研发计划、陕西省自然科学基金、中国博士后基金等科研项目或子任务10余项，立项经费800余万元。《高效安全羊基因编辑育种关键技术创新》获第十三届（2024年）大北农科技奖二等奖（排名第2）。代表性科研项目和研究成果如下：

4.1代表性科研项目

[9] 国家自然科学基金生物育种专项, 32441080, 2025.01-2029.12, 在研, 任务负责人.

[8] 国家农业生物育种重大专项, 2023ZD04074, 2023.11-2025.12, 在研, 任务负责人.

[7] 国家农业生物育种重大专项, 2023ZD04051, 2023.09-2025.12, 在研, 任务负责人.

[6] 陕西省重点研发计划, 2024NC-YBXM-098, 2024.01-2025.12, 在研, 主持.

[5] 深圳市自然科学基金重点项目, 基础20220161, 2023.01-2025.12, 在研, 任务负责人.

[4] 陕西省重点研发计划, 2021NY-027,  2021.01-2022.12, 结题, 主持.

[3] 中国博士后科学基金特别资助, 2018T111111,  2019.01-2020.12, 结题, 主持.

[2] 国家转基因生物新品种培育重大专项, 2018ZX0801009B, 2018.01-2020.06, 结题, 任务负责人.

[1] 国家自然科学基金青年项目, 31702099,  2018.01-2020.12, 结题, 主持.

4.2 代表性学术论著（^#同等贡献，*通讯作者）

（1）动物基因编辑与分子设计育种方向

[10] Yinghui Wei, Pengfei Gao, Deng Pan4, Guoling Li, Yufei Chen, ..., Kun Xu*, Zhaowei Wu*, Xiaolong Wang*. Engineering eukaryotic transposon-encoded Fanzor2 system for genome editing in mammals. Nat Chem Biol. 2025 May 20.  (2024: IF=13.3306, 学校G1/中科院生化与分子生物学1区Top期刊)

[9] 周冰倩, 李尚朴, 王旭, 孟祥宇, 邓竞荣, 邢金良*, 王建刚, 徐坤*. 双定位信号增强工程化蛋白线粒体靶向性呈递. 遗传, 2024, 46(11): 937-946. (A类学报/学院B, 封面论文)

[8] Lyu Ming, Sun Yongsen, Yan Nana, Chen Qiang, Wang Xin, Wei Zehui, Zhang Zhiying, Xu Kun*. Efficient CRISPR/Cas9-mediated gene editing in mammalian cells by the novel selectable traffic light reporters. Int J Biol Macromol. 2023 May; 243:124926. (2022: IF=8.1996, 学院A/中科院化学1区Top期刊)

[7] Lyu Ming, Li Fang, Wang Xu, Xu Kun*, Shuang Sun*. miR-145 Modulates Fatty Acid Metabolism by Targeting FOXO1 to Affect SERBP1 Activity in Bovine Mammary Epithelial Cells. J Agric Food Chem. 2023 May; 71(19):7440-7450. (2022: IF=6.1004, 学院A/中科院农林科学1区Top期刊)

[6] Ma Lixia, Xing Jiani, Li Qian, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. Development of a universal antibiotic resistance screening reporter for improving efficiency of cytosine and adenine base editing. J Biol Chem. 2022 Jul; 298(7):102103.  (2021: IF=5.4853, 学校G2/中科院生物学2区Top期刊)

[5] 张潇筠, 徐坤*, 沈俊岑, 穆璐, 钱泓润, 崔婕妤, 马宝霞, 陈知龙, 张智英, 魏泽辉*. 一种新型提高HDR效率的CRISPR/Cas9-Gal4BD供体适配基因编辑系统. 遗传. 2022, 36(5): 849-60. (A类学报/学院B, 封面论文)

[4] Ren Chonghua^#, Xu Kun^#, David Jay Sega, Zhang Zhiying*. Strategies for the enrichment and selection of genetically modified cells. Trends Biotechnol. 2019 Jan; 37(1):56-71. (2018: IF= 13.7464, 中科院工程技术1区Top期刊)

[3] Li Xinyi, Bai Yichun, Cheng Xinzhen, Peter Girgis Tawfek Kalds, Sun Bing, Wu Yun, Lyu Huijiao, Xu Kun*, Zhang Zhiying*. Efficient SSA-mediated precise genome editing using CRISPR/Cas9. FEBS J. 2018 Sep; 285(18):3362-75. (2017: IF= 4.5298, 中科院生物学2区, Editor’s Choice论文)

[2] Shao Simin, Ren Chonghua, Liu Zhongtian, Bai Yichun, Chen Zhilong, Wei Zehui, Wang Xin, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. Enhancing CRISPR/Cas9-mediated homology directed repair in mammalian cells by expressing Saccharomyces cerevisiae Rad52. Int J Biochem Cell Biol. 2017 Nov; 92:43-52. (2016: IF= 3.5049, 中科院生物学2区)

[1] Xu Kun, Ren Chonghua, Liu Zhongtian, Zhang Tao, Zhang Tingting, Li Duo, Wang Ling, Yan Qiang, Guo Lijun, Shen Juncen, Zhang Zhiying*.Efficient genome engineering in eukaryotes using Cas9 from Streptococcus thermophilus . Cell Mol Life Sci. 2015 Jan; 72(2):383-99. (2014: IF= 5.8077, 中科院生物学2区)

（2）微生物基因编辑与合成生物学方向

[7] 赵霞芳, 杜丽宏, 马宝霞, 贾劭娜, 刘宇飞, 朱宇飞, 麻啸涛, 杨小军*, 徐坤*. 产肠毒素大肠杆菌DNA疫苗重组酵母菌体微胶囊开发. 生物工程学报, 2025, 41(6): 2388-2404. (A类学报/卓越期刊/学院B)

[6] Lihong Du, Shaona Jia, Wenqiang Zhang, ..., Xiaojun Yang, Zehui We*, Kun Xu*. Oral Yeast-Cell Microcapsule-Mediated DNA Vaccines Against Clostridium perfringens Induce Effective Intestinal Immunity and Modulate Gut Microbiota. Vaccines (Basel). 2024 Dec; 12(12):1360. doi: 10.3390/vaccines12121360. ( 2023-IF=5.2002)

[5] 刘宇飞, 曹颖, 常立业, 单聪慧, 徐坤*. 毕赤酵母细胞工厂工程化改造与应用. 生物工程学报. 生物工程学报. 2023, 39(11): 4376-4396. (A类学报/卓越期刊/学院B)

[4] Yue Feng, Du Lihong, Wang Ruyu, Han Baoquan, Zhang Xiaojun, Yao Zhangzhang, Zhang Wenqiang, Cai Chang, Zhang Zhiying*, Xu Kun*. In vivo Protein Interference Oral Administration of Recombinant Yeast-Mediated Partial Leptin Reduction for Obesity Control. Front Microbiol. 2022 Jun 14; 13:923656. (2021: IF=6.0644, 中科院生物学2区Top期刊)

[3] Hafiz Muhammad Zakria, Han Baoquan, Yue Feng, Mu Lu, Fang Yuanyuan, Li Xiaoyu, Xu Kun*, Zhang Zhiying*. Significant body mass increase by oral administration of a cascade of shIL21-MSTN yeast-based DNA vaccine in mice. Biomed Pharmacother. 2019 Oct; 118:109147. (2018: IF= 3.7426, 中科院医学2区)

[2] Han Baoquan^#, Xu Kun^#,*, Liu Zhongtian, Ge Wei, Shao Simin, Li Pengcheng, Yan Nana, Li Xinyi, Zhang Zhiying*. Oral yeast-based DNA vaccine confers effective protection from Aeromonas hydrophila infection on Carassius auratus. Fish Shellfish Immunol. 2019 Jan; 84:948-54. (2018: IF= 3.2980, 中科院农林科学类1区Top期刊)

[1] Luo Zhixin, Wang Shanhe, Jiao Beilei, Yuan Dan, Dai Dongmei, Wang Lixian, Xu Kun*, Wang Xin*.Gene cloning and seamless site-directed mutagenesis using single strand annealing (SSA). Appl Microbiol Biotechnol. 2018 September 12; 102 (23):10119-26.  (2017: IF=3.3400, 中科院工程技术2区Top期刊)

（3）专著/丛书章节论文

[2].Zhang Zhiying, Segal David Jay, Xu Kun, eds (2020). Precise Genome Editing Techniques and Applications. Lausanne: Frontiers Media SA. doi: 10.3389/978-2-88963-779-9.

[1] Xu Kun, Liu Zhongtian, Zhang Long, Zhang Tingting, Zhang Zhiying. SiRNA In Vivo-Targeted Delivery to Murine Dendritic Cells by Oral Administration of Recombinant Yeast. In: Shum K., Rossi J. (eds) SiRNA Delivery Methods (Chapter 14). Methods in Molecular Biology (2016), vol 1364. Humana Press, New York, NY.

4.3 代表性发明专利

[9] 一种优化的NlovFz2-ωRNA编辑系统. 魏迎辉, 徐坤, 王小龙, 郑文新, 高鹏飞, 李尚朴, 吴伟伟, 姜鹤楠, 岳阳, 伍振旻, 杨冲, 任宇佳. 申请号CN202411627205.2. 申请日期2024/11/24.

[8] 防治柱状黄杆菌感染的口服重组酵母菌株及其制备方法和应用. 徐坤, 姚长长, 张存芳, 刘宇飞, 敖峻珩, 贾劭娜, 宋维杰, 郝佳慧, 蔡伟杰. 申请号CN202310729111.5. 申请日2023/06/19.

[7] 红绿光切换式交通信号灯基因编辑阳性报告富集系统. 徐坤, 吕明, 张智英, 马宝霞,王旭, 孟祥宇, 李尚朴, 杨森. 申请号CN202310388217.3. 申请日2023/04/12.

[6] 一种口服酵母介导的产气荚膜梭菌α毒素重组DNA疫苗. 徐坤, 杨小军, 张文强, 杜丽宏, 姚长长, 麻啸涛, 朱宇飞, 贾邵娜, 刘宇飞, 蔡畅, 赵霞芳, 汪楚涵, 单聪慧. 申请号CN202310275151.7. 申请日2023/03/20.

[5] 一种增强基因表达的自激活Gal4/UAS系统表达盒的建立. 徐坤, 刘玉万, 张智英,娜娜, 雒志新, 韩宝泉, 李欣憶, 张哓兰. ZL 201710381327.1.授权日期2020/5/19.

[4] 一种融合核酸外切酶的 CRISPR/Cas12i 基因编辑衍生系统及其应用. 王小龙, 魏迎辉, 徐坤, 郑文新, 吴伟伟, 陈秋崇, 姚方瑶, 罗沐华. 申请号CN202410457560.3. 申请日期2024/04/16.

[3] 基于人工核酸酶的可视化细胞修复效率报告系统及其建立方法. 张智英, 邵斯旻, 徐坤, 韩芙蓉, 沈俊岑, 白义春. ZL201611020358.6. 授权日期2020/4/21.

[2] 一种利用CRISPR/Cas9技术基于SSA修复的基因无缝编辑方法. 张智英, 白义春, 徐坤, 魏泽辉, 和林洁, 任充华, 邵斯旻, 吴芸, 刘中天. ZL201610333062.3. 授权日期2019/10/11.

[1] 基于CRISPR/Cas9的外源基因敲入整合系统及其建立方法和应用. 张智英, 吴芸, 徐坤, 白义春, 吕慧娇. ZL201610703246.4. 授权日期2019/10/8. 转让日期2021/10/29.

5．联系方式

通讯地址：陕西杨凌西农路22号西农大北校区动物科技学院

邮编：712100

Email：xukunas@nwafu.edu.cn, 564737724@qq.com

（更新时间2025.06.18）